A Kísérleti Orvostudományi Kutatóintézet fő kutatási témája az idegrendszer vizsgálata és megértése.
Mindez annak érdekében, hogy egyrészt növelje ismereteinket az agyról, ezzel hozzájárulva a társadalom számára hatalmas terhet jelentő, az idegrendszerrel összefüggésbe hozható betegségek gyógyításához.

Másrészt tevékenységével elősegítse az orvos-diagnosztikai és az agykutatási módszerek fejlődését.